Als gevolg van een zeer lokale regenbui een klein kwartier voor de race, die het eerste deel van het circuit tot bocht 3 onder water had gezet, werd de start van de 10e MotoGP race van het seizoen met ruim een half uur vertraagd, maar dat bracht Marc Marquez niet van de wijs.
Na op zaterdag op een halfnatte baan zijn 58e pole position te hebben gerealiseerd in de MotoGP was er ook in race geen maat op de zevenvoudig wereldkampioen, die bij de start de leiding nam, de openingsfase controleerde om halverwege de race afstand te nemen van van Andrea Dovizioso, die vanaf de vierde plaats op de grid dankzij het holeshot device Jack Miller en Johann Zarco voorbij was gegaan.
Tien ronden lang hield Dovizioso het gat op Marquez tot een halve seconde beperkt en wist op zijn beurt de sterk rijdende Alex Rins achter zich te houden, die in de derde ronde Jack Miller voorbij was gegaan. Daarna zette Marquez de naverbrander aan en liep langzaam maar zeker bij de 2018 winnaar weg, om uiteindelijk met een veilige voorsprong van tweeënhalve seconde als winnaar te worden afgevlagd, zijn zesde van het seizoen.
De derde en laatste podiumplaats ging met nog twee ronden te gaan naar Jack Miller, die in tegenstelling tot Rins zijn achterband nét iets beter had gespaard en in de slotfase snellere tijden reed. Bij zijn eerste aanval in bocht 1 counterde Rins meteen terug, maar enkele bochten later probeerde Miller het opnieuw en gooide daarna meteen de deur dicht, en stelde daarmee zijn tweede podium van het seizoen veilig.
Op vijf seconden van Marquez finishte Rins op de vierde plaats en bleef daarmee Cal Crutchlow nog nipt voor, die lange tijd met Valentino Rossi in gevecht en in de slotfase een van de snelste rijders op de baan was geweest. Voor Yamaha was het een slecht begin van het tweede deel van het seizoen, Rossi finishte als beste Yamaha coureur op de zesde plaats, terwijl teamgenoot Maverick Vinales na een slechte start lange tijd op de 15e plaats lag, om uiteindelijk op de 10e plaats te worden afgevlagd.
MotoGP Brno, uitslag race:
| Rijder | Team | Merk | km/u | Tijd/verschil | ||
| 1 | Marc MARQUEZ | SPA | Repsol Honda Team | Honda | 164.5 | 39'24.430 |
| 2 | Andrea DOVIZIOSO | ITA | Ducati Team | Ducati | 164.3 | 2.452 |
| 3 | Jack MILLER | AUS | Pramac Racing | Ducati | 164.2 | 3.497 |
| 4 | Alex RINS | SPA | Team SUZUKI ECSTAR | Suzuki | 164.1 | 4.858 |
| 5 | Cal CRUTCHLOW | GBR | LCR Honda CASTROL | Honda | 164.1 | 6.007 |
| 6 | Valentino ROSSI | ITA | Monster Energy Yamaha MotoGP | Yamaha | 163.8 | 9.083 |
| 7 | Fabio QUARTARARO | FRA | Petronas Yamaha SRT | Yamaha | 163.6 | 12.092 |
| 8 | Danilo PETRUCCI | ITA | Ducati Team | Ducati | 163.5 | 13.976 |
| 9 | Takaaki NAKAGAMI | JPN | LCR Honda IDEMITSU | Honda | 163.4 | 15.724 |
| 10 | Maverick VIÑALES | SPA | Monster Energy Yamaha MotoGP | Yamaha | 163.3 | 16.558 |
| 11 | Pol ESPARGARO | SPA | Red Bull KTM Factory Racing | KTM | 163.2 | 18.234 |
| 12 | Francesco BAGNAIA | ITA | Pramac Racing | Ducati | 163.1 | 19.738 |
| 13 | Miguel OLIVEIRA | POR | Red Bull KTM Tech 3 | KTM | 162.9 | 22.539 |
| 14 | Johann ZARCO | FRA | Red Bull KTM Factory Racing | KTM | 162.4 | 30.459 |
| 15 | Stefan BRADL | GER | Repsol Honda Team | Honda | 162.4 | 30.500 |
| 16 | Tito RABAT | SPA | Reale Avintia Racing | Ducati | 162.4 | 30.755 |
| 17 | Andrea IANNONE | ITA | Aprilia Racing Team Gresini | Aprilia | 161.9 | 37.170 |
| 18 | Aleix ESPARGARO | SPA | Aprilia Racing Team Gresini | Aprilia | 161.9 | 37.343 |
| 19 | Karel ABRAHAM | CZE | Reale Avintia Racing | Ducati | 161.5 | 44.296 |
| 20 | Sylvain GUINTOLI | FRA | Team SUZUKI ECSTAR | Suzuki | 161.1 | 48.938 |
| DNF | ||||||
| Hafizh SYAHRIN | MAL | Red Bull KTM Tech 3 | KTM | 162.2 | 14 Laps | |
| Franco MORBIDELLI | ITA | Petronas Yamaha SRT | Yamaha | 0 Lap | ||
| Joan MIR | SPA | Team SUZUKI ECSTAR | Suzuki | 0 Lap |
Tussenstand:
| Naam | Merk | |||
| 1 | Marc MARQUEZ | Honda | SPA | 210 |
| 2 | Andrea DOVIZIOSO | Ducati | ITA | 147 |
| 3 | Danilo PETRUCCI | Ducati | ITA | 129 |
| 4 | Alex RINS | Suzuki | SPA | 114 |
| 5 | Maverick VIÑALES | Yamaha | SPA | 91 |