De eerste dag van race 2 van het seizoen op het Mandalika Street Circuit, de eerste Indonesische Grand Prix sinds 1997, leek Yamaha opnieuw te moeten incasseren. Franco Morbidelli had weliswaar aan het eind van FP1 de vierde tijd gezet, op 3 tiende seconde van het trio Pol Espargaro, Miguel Oliveira en Marc Marquez die op P3 slechts 79 duizendste langzamer dan z'n teamgenoot was geweest, maar had daarvoor wel bijna als enige een nieuwe soft/soft combinatie gebruikt.
Quartararo had daarentegen net als bijna het hele veld geen nieuwe banden ingestoken voor een time-attack en was niet verder gekomen dan de 16e tijd, op bijna 1,3 seconde van Espargaro, en reageerde meer dan op de baan de frustratie van zich af.
De start van FP2 verliep vervolgens voor Quartararo eveneens verre van ideaal. In zijn eerste vliegende ronde verbeterde hij weliswaar de snelste tijd van Pol Espargaro in FP1, maar moest de ronde erna zijn M1 aan de kant zetten met een technisch probleem, waarna iedereen zijn tijd verbeterde en hij weer wegzakte in het veld.
Met nog een kwartier op de klok zat het veld nog ontzettend dicht bij elkaar, met de top 20 binnen 8 tiende van een seconde en de snelste tijd al twintig minuten in handen van Miguel Oliveira, die in zijn 6e vliegende ronde een 1'32.707 had gezet, ruim 8 tiende sneller dan zijn snelste tijd in de ochtend. Dat was echter het moment dat het kwartje bij Yamaha wél de goede kant op viel.
In zijn 13e ronde op de nieuwe Medium/Soft combinatie waarmee hij de sessie was gestart ging Quartararo 0.137 seconde onder de tijd van Oliveira door, dook daarna de pits in om met een nieuwe Medium/Soft combinatie nog eens bijna een hele seconde van zijn eigen tijd af te rijden. Met een 1'31.608 dook Quartararo 3 honderdste onder de tijd die teamgenoot Franco Morbidelli luttele seconden daarvoor had gezet. Het Yamaha fabrieksteam deelde daarmee een flinke tik uit aan de rest van het veld, dat vlak daarvoor nog een Ducati-lockout leek te gaan worden.
Zo voortvarend als de time-attack voor het Yamaha fabrieksteam verliep, zo dramatisch verliep deze voor het Repsol Honda Team. Als laatste voor een time-attack de baan op gegaan zag de 8-voudig wereldkampioen zijn jacht op een top-10 tijd in de grindbak eindigen en kwam daardoor niet verder dan een teleurstellende 22e tijd. Teamgenoot Pol Espargaro had in zijn time-attack slechts de 19e tijd gezet.
De crash van Marc Marquez was ook zeer noodlottig voor Pecco Bagnaia, die daardoor zijn snelle ronde moest afbreken, dat dat vlak daarvoor ook al vanwege de gecrashte Enea Bastianini had moeten doen en daardoor met de 21e tijd genoeg moest nemen.
MotoGP Mandalika, tijden vrije training:
| Rijder | Team | Merk | FP1 | FP2 | Verschil | ||
| 1 | Fabio Quartararo | FRA | Monster Energy Yamaha MotoGP | Yamaha | 1'34.793 | 1'31.608 | |
| 2 | Franco Morbidelli | ITA | Monster Energy Yamaha MotoGP | Yamaha | 1'33.881 | 1'31.638 | 0.030 |
| 3 | Johann Zarco | FRA | Pramac Racing | Ducati | 1'34.242 | 1'31.893 | 0.285 |
| 4 | Jorge Martin | ESP | Pramac Racing | Ducati | 1'35.525 | 1'31.904 | 0.296 |
| 5 | Enea Bastianini | ITA | Gresini Racing MotoGP | Ducati | 1'34.327 | 1'31.921 | 0.313 |
| 6 | Jack Miller | AUS | Ducati Lenovo Team | Ducati | 1'34.562 | 1'31.965 | 0.357 |
| 7 | Aleix Espargaro | ESP | Aprilia Racing | Aprilia | 1'34.252 | 1'32.008 | 0.400 |
| 8 | Brad Binder | RSA | Red Bull KTM Factory Racing | KTM | 1'34.275 | 1'32.017 | 0.409 |
| 9 | Miguel Oliveira | PRT | Red Bull KTM Factory Racing | KTM | 1'33.543 | 1'32.049 | 0.441 |
| 10 | Alex Rins | ESP | Team SUZUKI ECSTAR | Suzuki | 1'34.893 | 1'32.106 | 0.498 |
| 11 | Andrea Dovizioso | ITA | WithU Yamaha RNF MotoGP Team | Yamaha | 1'34.592 | 1'32.303 | 0.695 |
| 12 | Takaaki Nakagami | JPN | LCR Honda IDEMITSU | Honda | 1'34.707 | 1'32.314 | 0.706 |
| 13 | Maverick Viñales | ESP | Aprilia Racing | Aprilia | 1'34.715 | 1'32.344 | 0.736 |
| 14 | Fabio Di Giannantonio | ITA | Gresini Racing MotoGP | Ducati | 1'36.838 | 1'32.418 | 0.810 |
| 15 | Marco Bezzecchi | ITA | Mooney VR46 Racing Team | Ducati | 1'35.258 | 1'32.471 | 0.863 |
| 16 | Alex Marquez | ESP | LCR Honda Castrol | Honda | 1'34.897 | 1'32.554 | 0.946 |
| 17 | Raul Fernandez | ESP | Tech3 KTM Factory Racing | KTM | 1'34.676 | 1'32.5570 | 0.949 |
| 18 | Remy Gardner | AUS | Tech3 KTM Factory Racing | KTM | 1'35.186 | 1'32.626 | 1.018 |
| 19 | Pol Espargaro | ESP | Repsol Honda Team | Honda | 1'33.499 | 1'32.628 | 1.020 |
| 20 | Joan Mir | ESP | Team SUZUKI ECSTAR | Suzuki | 1'34.479 | 1'32.641 | 1.033 |
| 21 | Pecco Bagnaia | ITA | Ducati Lenovo Team | Ducati | 1'34.357 | 1'32.845 | 1.237 |
| 22 | Marc Marquez | ESP | Repsol Honda Team | Honda | 1'33.578 | 1'32.847 | 1.239 |
| 23 | Darryn Binder | RSA | WithU Yamaha RNF MotoGP Team | Yamaha | 1'37.116 | 1'33.014 | 1.406 |
| 24 | Luca Marini | ITA | Mooney VR46 Racing Team | Ducati | 1'36.771 | 1'33.223 | 1.615 |