Na de over twee dagen verdeelde 48H Chrono, die de deelnemers tot het uiterste dreef, was de 3e etappe van de 2025 Dakar rally iets rustiger voor de rijders. Omdat onweer voor onveilige omstandigheden zorgde in de regio Al Henakiyah werd de etappe ingekort tot 327 kilometer, waarna alle rijders over verharde wegen naar het bivak bij Al Henakiyah reden.
KTM-fabrieksrijder Daniel Sanders had tot nu toe de 47e editie gedomineerd, met winst in de proloog en winst in de eerste twee etappes, en had daarmee een ruime voorsprong van ruim 12 minuten op HRC rijder Skyler Howes opgebouwd. Voor het eerst als eerste gestart bepaalde Sanders aan het begin van de derde etappe opnieuw het tempo, maar verloor in de tweede helft van de special veel terrein.
De 30-jarige Australiër zat bijna acht minuten achter Bradley Cox op de KTM 450 RALLY van het BAS World KTM Racing Team. Achter de Zuid-Afrikaan reed Sherco fabrieksrijder Lorenzo Santolino op de tweede plaats, gevolgd door Tosha Schareina op zijn Honda, die Sanders en Howes nu op de piste had ingehaald. Hero-ster en wereldkampioen Ross Branch lag op dit moment op de 4e plaats.
Skyler Howes was de eerste rijder die de finish van de etappe bereikte. Sherco-ace Lorenzo Santolino pakte echter de dagzege op het rechte stuk. De Spanjaard verzekerde zich van zijn eerste Dakar-etappeoverwinning met een voorsprong van slechts 1 minuut en 21 seconden minuten op Bradley Cox, die het grootste deel van de etappe aan de leiding had gereden maar aan het eind tijd verloor. Net als de Red Bull KTM rijders rijdt Cox op een fabrieksmotor.
Achter Santolino en Cox maakten Ricky Brabec (Honda), Skyler Howes en Ross Branch (Hero) de top vijf compleet. Daniel Sanders verloor 19 minuten en 9 seconden op Santolino, maar kreeg wel 4 minuten en 20 seconden aan bonustijd terug en zag zijn voorsprong in het algemeen klassement verdampen tot 1 minuut en 57 seconden op Skyler Howes, die met het kleinste verschil van 8 seconden Ross Branch voorbij is gegaan.
Dakar 2025, uitslag etappe 3:
| Rijder | Team | Tijd | Verschil | Tijdstraf | |
| 1 | ESP | LORENZO SANTOLINO | SHERCO RALLY FACTORY | 03H44'34'' | |
| 2 | ZAF | BRADLEY COX | BAS WORLD KTM RACING TEAM | 03H45'55'' | +00H01'21'' |
| 3 | USA | RICKY BRABEC | MONSTER ENERGY HONDA HRC | 03H48'35'' | +00H04'01'' |
| 4 | USA | SKYLER HOWES | MONSTER ENERGY HONDA HRC | 03H48'44'' | +00H04'10'' |
| 5 | BWA | ROSS BRANCH | HERO MOTOSPORTS TEAM RALLY | 03H48'48'' | +00H04'14'' |
| 6 | ARG | LUCIANO BENAVIDES | RED BULL KTM FACTORY RACING | 03H49'29'' | +00H04'55'' |
| 7 | SVK | STEFAN SVITKO | SLOVNAFT RALLY TEAM | 03H49'36'' | +00H05'02'' |
| 8 | CHL | PABLO QUINTANILLA | MONSTER ENERGY HONDA HRC | 03H49'53'' | +00H05'19'' |
| 9 | ESP | EDGAR CANET | RED BULL KTM FACTORY RACING | 03H50'05'' | +00H05'31'' |
| 10 | CZE | MARTIN MICHEK | ORION - MOTO RACING GROUP | 03H51'16'' | +00H06'42'' |
Tussenstand:
| Rijder | Team | Tijd | Verschil | Tijdstraf | ||
| 1 | AUS | DANIEL SANDERS | RED BULL KTM FACTORY RACING | 20H09'54'' | ||
| 2 | USA | SKYLER HOWES | MONSTER ENERGY HONDA HRC | 20H11'51'' | +00H01'57'' | |
| 3 | BWA | ROSS BRANCH | HERO MOTOSPORTS TEAM RALLY | 20H11'59'' | +00H02'05'' | |
| 4 | USA | RICKY BRABEC | MONSTER ENERGY HONDA HRC | 20H14'15'' | +00H04'21'' | |
| 5 | ESP | TOSHA SCHAREINA | MONSTER ENERGY HONDA HRC | 20H18'11'' | +00H08'17'' | |
| 6 | ARG | LUCIANO BENAVIDES | RED BULL KTM FACTORY RACING | 20H22'31'' | +00H12'37'' | 00H02'00'' |
| 7 | CHL | PABLO QUINTANILLA | MONSTER ENERGY HONDA HRC | 20H25'36'' | +00H15'42'' | |
| 8 | FRA | ADRIEN VAN BEVEREN | MONSTER ENERGY HONDA HRC | 20H26'18'' | +00H16'24'' | 00H02'00'' |
| 9 | ZAF | BRADLEY COX | BAS WORLD KTM RACING TEAM | 20H50'02'' | +00H40'08'' | |
| 10 | CHL | JOSE IGNACIO CORNEJO FLORIMO | HERO MOTOSPORTS TEAM RALLY | 20H51'12'' | +00H41'18'' | 00H02'00'' |
